Der Vorstand besteht aus sieben Mitglieder der Konferenz, dem Generalsekretär sowie den Vorsitzenden der drei Fachkonferenzen. Der Vorstand vertritt die Konferenz nach aussen. Der Vorstand beruft die Plenarversammlungen ein, bereitet deren Entscheide vor und überwacht deren Umsetzung.
Regierungsrat Paul Winiker
Vorsteher Justiz- und Sicherheitsdepartement, Kanton Luzern / Präsident RK MZF
Regierungsrätin Cornelia Komposch
Vorsteherin des Departements für Justiz und Sicherheit, Kanton Thurgau
Staatsrat Norman Gobbi
Direktor des Departements der Institutionen, Kanton Tessin
Regierungsrat Philippe Müller
Vorsteher der Sicherheitsdirektion, Kanton Bern
Regierungsrat Dimitri Moretti
Vorsteher der Sicherheitsdirektion, Kanton Uri
Landesfähnrich Jakob Signer
Vorsteher Justiz-, Polizei- und Militärdepartement, Kanton Appenzell Innerhoden
Staatsrat Frédéric Favre
Vorsteher des Departementes für Sicherheit, Institutionen und Sport, Kanton Wallis
Oberst i Gst Diego Ochsner
Präsident KVMBZ, Chef Amt für Militär und Bevölkerungsschutz, Kanton Solothurn
Petra Prévôt, lic. iur.
Generalsekretärin FKS
PD Dr. phil. Alexander Krethlow
Generalsekretär RK MZF